PMSISoft propose et calcule des algorithmes d'analyses PMSI, conçus à dire d'expert sur la base des cahiers des charges et des référentiels du PMSI. Ces algorithmes produisent des requêtes identifiées et documentées.

Il est de la seule responsabilité de l'établissement de juger de l'opportunité et de la cohérence d'appliquer les résultats de ces requêtes au redressement des données de codage de l'établissement.